2021年2月19日,《Bioinformatics》(中科院数学与计算生物学1区 TOP期刊)在线发表了深圳大学生命与海洋科学学院本科生李钧语为第一作者,题为“MitoFlex: an efficient, high-performance toolkit for animal mitogenome assembly, annotation, and visualization”的研究论文。我院张煜副教授(通讯作者)、汪安泰老师为本研究指导教师。
动物线粒体基因组(MT genomes)包含了具有高拷贝数但数量有限的基因,可为生物多样性和进化研究提供重要证据。本研究构建了针对动物线粒体全基因组高通量测序数据的原始数据过滤、序列拼接、线粒体基因组注释的高效一体化软件平台。与目前主流同类软件相比,本平台在运算速度、多线程资源利用率、基因注释灵敏度等方面均有显著优势,为基于线粒体数据的相关研究提供了有力工具。
该论文作者李钧语(第一作者,2018级本科生)、李伟轩(第二作者,2016级本科生,2020年直博北大)为深圳大学“大学生‘小平科技创新团队’”成员。该团队以培育大学生创新能力与综合素质为目的,近年来创新成果显著,获得国家级、省级“挑战杯”大奖20多项,发表学生第一作者论文69篇,其中SCI收录论文23篇,近四年培育“荔园卓越之星”2人,“荔园卓越之星提名奖”4人,“荔园之星”10多人。
本研究成果得到广东省团委广东省科技创新战略专项资金(“攀登计划”专项基金,pdjh2020b0509)、深圳大学校团委(涡虫多样性中国战队)青创基金、大学生创新训练项目(S202010590039),深圳大学创新发展基金(2019264),深圳市科创委(KQJSCX20170727101743831),广东省自然科学基金(2020A1515011117)等项目的资助。